compustat数据库
1、为了更深入地探索生物信息分析的领域cistrome数据库,以下数据库和资源网站是不可多得的工具Oncomineoncomineorg特别适用于差异分析cistrome数据库,提供了丰富的癌症基因表达数据GEPIAgepiacancerpkucn专注于共表达分析cistrome数据库,对于理解基因间相互作用提供独特的视角TIMER是进行免疫浸润分析的。
2、登录Timer数据库,选择“Diff Exp”模块,输入分子“TGFB2”,点击提交获取的图将直观展示TGFβ2在不同癌症组织中的表达差异复现工具 仙桃学术工具 访问xiantaoloveproducts,使用高级版生信分析工具,选择“表达差异挑”,设置疾病为“泛癌”,分子为“TGFB2”。
3、然后是差异基因表达Diff Exp板块,用于探讨肿瘤组织与正常组织之间的基因表达差异输入感兴趣的基因,系统将显示其在 TCGA 数据库中所有癌症组织和正常组织中的表达差异,为理解基因在不同状态下的作用提供依据紧接着是相关性Correlation板块,允许用户探索基因之间的相关性选择肿瘤类型并输入两cistrome数据库;最新发表于Computational and Structural Biotechnology Journal杂志,影响因子727分的文章,探讨MXD3作为泛癌免疫标志物,涵盖肿瘤微环境疾病分期预后及治疗反应研究下载TCGA和GTEx数据库数据复现任务包括1 确认MXD3蛋白突变体定位单细胞变异功能伴侣及表达谱2 通过。
4、用ChIPSeq公共数据探索组蛋白表观遗传修饰参与目标基因的调控情况在生信研究中,各式的seq数据一直是深受生信人喜爱的研究样本来源想Cistrome DBCistrome Data Browser数据库收录了人类和小鼠的ChIPseq数据,包括转录因子染色质调控因子组蛋白修饰等五万多个样本数据,是目前公认最全面的ChIPseq数据。